G-kwadrupleks

G-kwadrupleks (G4-DNA) – sekwencja polinukleotydów, która formuje specyficzną strukturę tetrad guaninowych stabilizowanych poprzez wiązania wodorowe Hoogsteena. G4-DNA stabilizowane są dodatkowo przez zwykle kation potasowy. Mogą być formowane z DNA, RNA, LNA lub PNA. Możliwe są też kwadrupleksy hybrydowe, np. zawierające zarówno DNA, jak i RNA^[1]. G-kwadrupleksy mogą być formowane z jednej, dwóch^[2]^[3] lub czterech nici polinukleotydów.

W genomowym DNA sekwencje kwadrupleksowe występują między innymi w telomerach i miejscach regulatorowych.

Przypisy edytuj

↑ Jia-yu Zhang, Ke-wei Zheng, Shan Xiao, Yu-hua Hao, Zheng Tan. Mechanism and Manipulation of DNA:RNA Hybrid G-Quadruplex Formation in Transcription of G-Rich DNA. „Journal of the American Chemical Society”. 136 (4), s. 1381–1390, 2014. DOI: 10.1021/ja4085572. PMID: 24392825.
↑ KajiaK. Cao KajiaK., PaulP. Ryvkin PaulP., F. BradF.B. Johnson F. BradF.B., Computational detection and analysis of sequences with duplex-derived interstrand G-quadruplex forming potential, „Methods”, 57 (1), 2012, s. 3–10, DOI: 10.1016/j.ymeth.2012.05.002, PMID: 22652626, PMCID: PMC3701776 [dostęp 2019-11-26] (ang.).
↑ Andrzej SA.S. Kudlicki Andrzej SA.S., G-Quadruplexes Involving Both Strands of Genomic DNA Are Highly Abundant and Colocalize with Functional Sites in the Human Genome, Arthur J.A.J. Lustig (red.), „PLOS One”, 11 (1), 2016, e0146174, DOI: 10.1371/journal.pone.0146174, ISSN 1932-6203, PMID: 26727593, PMCID: PMC4699641 [dostęp 2019-11-26] (ang.).

[1] Jia-yu Zhang, Ke-wei Zheng, Shan Xiao, Yu-hua Hao, Zheng Tan. Mechanism and Manipulation of DNA:RNA Hybrid G-Quadruplex Formation in Transcription of G-Rich DNA. „Journal of the American Chemical Society”. 136 (4), s. 1381–1390, 2014. DOI: 10.1021/ja4085572. PMID: 24392825.

[2] KajiaK. Cao KajiaK., PaulP. Ryvkin PaulP., F. BradF.B. Johnson F. BradF.B., Computational detection and analysis of sequences with duplex-derived interstrand G-quadruplex forming potential, „Methods”, 57 (1), 2012, s. 3–10, DOI: 10.1016/j.ymeth.2012.05.002, PMID: 22652626, PMCID: PMC3701776 [dostęp 2019-11-26] (ang.).

[3] Andrzej SA.S. Kudlicki Andrzej SA.S., G-Quadruplexes Involving Both Strands of Genomic DNA Are Highly Abundant and Colocalize with Functional Sites in the Human Genome, Arthur J.A.J. Lustig (red.), „PLOS One”, 11 (1), 2016, e0146174, DOI: 10.1371/journal.pone.0146174, ISSN 1932-6203, PMID: 26727593, PMCID: PMC4699641 [dostęp 2019-11-26] (ang.).

[1]

[2]

[3]