Biblioteka genomowa: Różnice pomiędzy wersjami

Dodane 150 bajtów ,  9 lat temu
WP:SK, drobne techniczne
m (WikiCleaner 0.99 - Naprawa linku do strony ujednoznaczniającej)
(WP:SK, drobne techniczne)
'''Biblioteka genomowa''' (też: bank genów, bank genomowy) - to kolekcja [[Klon (genetyka)|klonów]] (zazwyczaj [[bakterie|bakterii]]), która jako całość zawiera co najmniej jedną kopię każdej sekwencji [[DNA]] obecnej w [[genom]]ie organizmu, którego bibliotekę genomową utworzono.
 
Powstaje przez pocięcie całego [[genom|genomu]]u danego organizmu [[enzymy restrykcyjne|enzymami restrykcyjnymi]], a następnie połączenie powstałych w ten sposób fragmentów DNA z [[Wektor genetyczny|wektorami]] (np. [[plazmid|plazmidami]]ami lub [[kosmid|kosmidami]]ami), tak że każdy wektor zawiera jeden, losowo wybrany fragment. Wektory te następnie wprowadza się do komórek bakteryjnych (np. bakterii [[pałeczka okrężnicy|''Escherichia coli'']]) - każda bakteria pobiera jeden wektor, a więc zawiera jeden fragment oryginalnego genomu. Taka bakteria, namnażając się, tworzy [[Klon (genetyka)|klon]] bakteryjny zawierający ten fragment. Tylko niektóre klony zawierają [[gen]]y, część zawiera tylko fragmenty genów, większość sekwencje niekodujące. Fragmenty DNA niesione przez dwa klony mogą nakładać się na siebie, gdyż powstały przez losowe cięcie wielu kopii oryginalnego genomu. Biblioteka genomowa powinna być odpowiednio duża, aby prawdopodobieństwo, że ''każdy'' fragment oryginalnego genomu jest w niej obecny, wynosiło co najmniej 99%.
 
W zależności od zastosowanego systemu wektorowego banki genów mogą być różnej wielkości. Na wielkość b.g.banku wpływa pojemność klonująca systemu wektorowego. B.g.Bank jest tym większy im bardziej skomplikowany jest organizm. Jest on konstruowany w sposób dość przypadkowy.
Wzór Clarka&Carbona jest wykorzystywany do określenia liczby koniecznych (wymaganych) rekombinantów (klonów):
 
Wzór Clarka&Carbona jestClarka–Carbona wykorzystywany do określenia liczby koniecznych (wymaganych) rekombinantów (klonów):
N=ln(1-P)/nl[1-(L-x/M)]
 
<math>N = {\operatorname{ln}(1-P)\over\operatorname{ln}\left[1-\left({L-x\over M}\right)\right]}</math>
 
gdzie:<br />
 
<math>N-</math> – liczba wymaganych klonów<br />
 
<math>P-</math> – prawdopodobieństwo z jakim jesteśmy w stanie znaleźć w danym banku dany gen<br />
gdzie:
<math>L-</math> – długość klonowanego fragmentu<br />
N-liczba wymaganych klonów
<math>x-</math> – wielkość szukanego genu<br />
P- prawdopodobieństwo z jakim jesteśmy w stanie znaleźć w danym banku dany gen
<math>M-</math> – wielkość genomu
L- długość klonowanego fragmentu
x- wielkość szukanego genu
M- wielkość genomu
== Rodzaje bibliotek genomowych ==
# Biblioteki [[plazmid|plazmidowe]]owe: Pojemnośćpojemność 10kb10 [[Para zasad|kb]]
# Biblioteki [[fag|fagowe]]owe: Pojemnośćpojemność 23 kb.
# Biblioteki [[kosmid|kosmidowe]]owe: Pojemnśćpojemnść 45 kb.
# Biblioteki YAC (Yeast artificial chromosome): Pojemnośćpojemność 1000 kb.
 
{{genetyka stub}}
 
[[Kategoria:Genetyka]]
2347

edycji