[[Wirusy]] są przyczyną około jednej trzeciej zachorowań<ref name=Lancet11/> u dorosłych i około 15% u dzieci<ref name=M31/>. Zapalenie płuc często wywołują [[Rinowirusy|rynowirusy]], [[Koronawirusy|koronawirusy]], [[wirus grypy]], [[wirus RSV|RSV]], [[Adenowirusy|adenowirusy]] oraz [[Wirus paragrypy|wirusy paragrypy]]<ref name=Lancet11/><ref name=Viral09/>. [[Wirus opryszczki pospolitej]] rzadko prowadzi do zapalenia płuc, z wyjątkiem takich grup, jak [[noworodek|noworodki]], biorcy [[Przeszczepianie narządów|przeszczepów]], osoby chorujące na [[nowotwór]] lub cierpiące z powodu poważnych [[oparzenie|oparzeń]]<ref name=Text2010>{{Cytuj książkę | nazwisko = Behera | imię = D. | tytuł = Textbook of pulmonary medicine | url = http://books.google.ca/books?id=0TbJjd9eTp0C&pg=PA391 | wydanie = 2. | wydawca = Jaypee Brothers Medical Pub. | miejsce = New Delhi | rok = 2010 | strony = 391–394 | isbn = 8184487495 | język = en}}</ref>. Osoby po transplantacjach niekompetentne immunologicznie z innego powodu często zapadają na zapalenie wywołane przez [[cytomegalowirus]]a<ref name=M31/><ref name=Text2010/>. Pacjenci z wirusowym zapaleniem płuc mogą być dodatkowo zakażeni również bakteriami ''Streptococcus pneumoniae'', ''Staphylococcus aureus'' czy ''Haemophilus influenzae'', zwłaszcza gdy występują inne choroby i powikłania<ref name=Clinic2011/><ref name=M31/>. Dominacja konkretnych wirusów wiąże się z porą roku; przykładowo podczas sezonu grypowego wirus grypy może stanowić przyczynę ponad połowy przypadków wirusowego zapalenia płuc<ref name=M31/>. Czasami pojawiają się także nagłe wybuchy ognisk zapalenia spowodowanego przez [[hantawirus]]y i [[koronawirusy]]<ref name=M31/>.
