Według Juvala Aviva, wieloletniego agenta Mosadu, uczestniczącego m.in. w [[Operacja Gniew Boży|operacji]] likwidacji palestyńskich zamachowców z organizacji [[Czarny Wrzesień (organizacja)|Czarny Wrzesień]] i założyciela firmy Interfor Inc., zamachu na samolot nie dokonały wcale libijskie, lecz irańskie służby specjalne, co więcej, za wiedzą i cichym przyzwoleniem CIA. Wyniki śledztwa prowadzonego przez jego firmę sugerują, że nie było żadnych zaginionych walizek między Maltą a Frankfurtem. Wskazuje na to raport oddziałów FBI i MI6 prowadzących po katastrofie dochodzenie we Frankfurcie, którego kopię otrzymała. Aviv twierdzi, że zamach był zemstą za omyłkowe [[Katastrofa lotu Iran Air 655|zestrzelenie]] przez amerykański okręt wojenny USS „Vincennes” [[Airbus A300]|Airbusa A300]] linii Iran Air nad Zatoką Perską 3 lipca 1988 roku. Zadanie odwetowego ataku na amerykański samolot zlecono libańskiemu terroryście i handlarzowi heroiny, Ahmedowi Jibrilowi. Narkotykowe interesy z Jibrilem prowadził także jakoby libański oddział CIA, przeznaczając osiągane w ten sposób zyski na wspieranie antysandinistowskiej partyzantki [[Contras]] w Nikaragui. Cały ten proceder został wykryty przez trójkę agentów CIA wysłanych z USA w celu ustalenia miejsca przetrzymywania grupy amerykańskich i brytyjskich zakładników, pojmanych w Bejrucie przez terrorystów. Gdy postanowili oni zawiadomić o całej sprawie Kongres, CIA choć dowiedziało się o bombie na pokładzie Boeinga 747, którym mieli wracać do kraju, nie podjęło żadnych prób udaremnienia zamachu. Departament Stanu wysłał jedynie ostrzeżenie dla amerykańskich dyplomatów i ich rodzin, by anulowali swoje rezerwacje na lot Pan Am 103. Jako dowody przedstawia m.in. nagranie, w którym CIA w Bejrucie zawiadamia centralę w Langley, że agenci wracają do Waszyngtonu i wykupili bilety na ten lot, oraz tekst ostrzeżenia Departamentu Stanu z lotniska w Moskwie<ref>http://www.uwazamrze.pl/artykul/873751/nie-lekcewazcie-terrorystow.</ref>. Teorię Aviva potwierdzają dodatkowo zeznania zbiegłego do Niemiec byłego oficera irańskich służb specjalnych Abolghasema Mesbahiego. Według tych informacji zajmująca się jego wykonaniem komórka Ludowego Frontu Wyzwolenia Palestyny działała na terenie Niemiec. Wszyscy jej członkowie nadal żyją na wolności, choć w przeszłości odsiedzieli wyroki za inne zamachy<ref>http://wiadomosci.dziennik.pl%2Fswiat%2Fartykuly%2F453085%2Cnowy-trop-wskazuje-ze-to-nie-libia-moze-odpowiadac-za-zamach-nad-lockerbie.</ref><ref>http://www.rmf24.pl%2Ffakty%2Fswiat%2Fnews-to-nie-libia-jest-odpowiedzialna-za-zamach-nad-lockerbie.</ref>.
