W Japonii produkowane były na cały świat 3 wersje:
–* Lancer Evolution IX RS (Rally Sport), to wersja pozbawiona systemu stereo, wygłuszeń pojazdu, klimatyzacji, centralnego zamka, elektrycznych szyb a nawet warstwy antykorozyjnej lakieru w celu zmniejszenia wagi. Jako jedyna wersja ma 5-biegową skrzynię biegów Jest to wersja stworzona do przebudowy na auta rajdowe,
–* Lancer Evolution IX GSR (Grand Sport Rally) wersja podstawowa,
–* Lancer Evolution IX GSR SE (Special Edition) mają dodatkowo w standardzie centralny zamek, tylną wycieraczkę, oraz lepsze wygłuszenie wnętrza,
–* Lancer Evolution IX MR (Mitsubishi Racing) oprócz tego co wersji SE dodatkowo znalazły się tu lżejsze aluminiowy dach, maska i klapa bagażnika, zainstalowany został poprawiający aerodynamikę 'Vortex Generator' czyli generator wirów powietrznych wyglądający jak malutkie rekinie płetwy na w tylnej części dachu (stąd popularna nazwa 'Shark Fins'), zawieszenie marki [[Bilstein]], oraz koła firmy [[BBS Kraftfahrzeugtechnik|BBS]].
Na polski rynek wprowadzono dwie wersje wyposażenia P01 (odpowiednik wersji GSR) oraz P03 (odpowiednik wersji SE dodatkowo z zawieszeniem [[Bilstein]] i kołami [[BBS Kraftfahrzeugtechnik|BBS]] z wersji MR).
