Biblioteka genomowa: Różnice pomiędzy wersjami

Usunięte 8 bajtów ,  1 rok temu
m
m (Dodaję nagłówek przed Szablon:Przypisy)
m (WP:SK+Bn)
{{Dopracować|źródła=2012-03}}
'''Biblioteka genomowa''' (też: bank genów, bank genomowy) – to kolekcja [[Klon (genetyka)|klonów]] (zazwyczaj [[bakterie|bakterii]]), która jako całość zawiera co najmniej jedną kopię każdej sekwencji [[Kwas deoksyrybonukleinowy|DNA]] obecnej w [[genom]]ie organizmu, którego bibliotekę genomową utworzono.
 
Powstaje przez pocięcie całego [[genom]]u danego organizmu [[enzymy restrykcyjne|enzymami restrykcyjnymi]], a następnie połączenie powstałych w ten sposób fragmentów DNA z [[Wektor genetyczny|wektorami]] (np. [[plazmid]]ami lub [[kosmid]]ami), tak że każdy wektor zawiera jeden, losowo wybrany fragment. Wektory te następnie wprowadza się do komórek bakteryjnych (np. bakterii [[pałeczka okrężnicy|''Escherichia coli'']]) – każda bakteria pobiera jeden wektor, a więc zawiera jeden fragment oryginalnego genomu. Taka bakteria, namnażając się, tworzy [[Klon (genetyka)|klon]] bakteryjny zawierający ten fragment. Tylko niektóre klony zawierają [[gen]]y, część zawiera tylko fragmenty genów, większość sekwencje niekodujące. Fragmenty DNA niesione przez dwa klony mogą nakładać się na siebie, gdyż powstały przez losowe cięcie wielu kopii oryginalnego genomu. Biblioteka genomowa powinna być odpowiednio duża, aby prawdopodobieństwo, że każdy fragment oryginalnego genomu jest w niej obecny, wynosiło co najmniej 99%.
 
Wzór Clarka–Carbona wykorzystywany do określenia liczby koniecznych (wymaganych) rekombinantów (klonów):
: <math>N = \frac{\operatorname{ln}(1-P)\over}{\operatorname{ln}\left[1-\left(\frac{L-x\over }{M}\right)\right]},</math>
 
gdzie:<br />
<math>N = {\operatorname{ln}(1-P)\over\operatorname{ln}\left[1-\left({L-x\over M}\right)\right]}</math>
: <math>N</math> – liczba wymaganych klonów<br />,
: <math>P</math> – prawdopodobieństwo z jakim jesteśmy w stanie znaleźć w danym banku dany gen<br />,
: <math>L</math> – długość klonowanego fragmentu<br />,
: <math>x</math> – wielkość szukanego genu<br />,
: <math>M</math> – wielkość genomu.
 
gdzie:<br />
<math>N</math> – liczba wymaganych klonów<br />
<math>P</math> – prawdopodobieństwo z jakim jesteśmy w stanie znaleźć w danym banku dany gen<br />
<math>L</math> – długość klonowanego fragmentu<br />
<math>x</math> – wielkość szukanego genu<br />
<math>M</math> – wielkość genomu
== Rodzaje bibliotek genomowych ==
# Biblioteki [[plazmid]]owe: pojemność 10 [[Para zasad|kb]]
# Biblioteki [[kosmid]]owe: pojemnść 45 kb
# Biblioteki YAC (Yeast artificial chromosome): pojemność 1000 kb
# Biblioteki BAC (ang. bacterial artificial chromosome - sztuczny chromosom bakteryjny): pojemność 100-300100–300 kb<ref>{{Cytuj|autor=Neil Campbell|tytuł=Biologia|data=2012|wydawca=Dom Wydawniczy REBIS|s=401}}</ref>
 
== Przypisy ==