Polimeraza RNA: Różnice pomiędzy wersjami

Usunięte 69 bajtów ,  2 lata temu
m
różne poprawki
(Anulowanie wersji 52373986 autora 109.173.218.43 (dyskusja), Potrzebne źródło)
Znacznik: Anulowanie edycji
m (różne poprawki)
 
'''Polimeraza RNA''', '''RNAP''' − [[Enzymyenzymy|enzym]] wytwarzający nić [[Kwasykwasy rybonukleinowe|RNA]] na matrycy [[Kwaskwas deoksyrybonukleinowy|DNA]] w procesie zwanym [[transkrypcja (genetyka)|transkrypcją]]. PolimerazaEnzym ten porusza się wzdłuż nici DNA w kierunku 3' → 5', a nić RNA powstaje w kierunku 5' → 3' z szybkością 50-100 zasad na sekundę.
 
Polimeraza RNA wykorzystująca jako matrycę nić DNA to polimeraza RNA zależna od DNA. U [[Wirusy|wirusów]] i roślin występują też [[polimerazy]] RNA zależne od RNA, które wykorzystują jako matrycę nić RNA.
 
== Polimerazy u bakterii ==
U [[bakterie|bakterii]] występuje jedna polimeraza RNA, syntetyzująca wszystkie rodzaje RNA. Składa się ona z 5 podjednostek: dwóch podjednostek α rozpoznających czynniki regulatorowe, podjednostki β katalizującej syntezę RNA, podjednostki β' wiążącej niespecyficznie DNA i podjednostki ω tworzących razem część rdzeniową enzymu. Do związania się z sekwencjami [[promotor genu|promotorowymi]] potrzebna jest jeszcze szósta podjednostka – sigma (σ). Taki enzym określa się jako holoenzym. Transkrypcja z większości promotorów ''[[Pałeczka okrężnicy|Escherichia coli]]'' prowadzona jest przez polimerazę RNA zawierającą czynnik σ<sup>70</sup>, ale podczas transkrypcji niektórych genów wykorzystywane są alternatywne czynniki sigma rozpoznające inne sekwencje promotorowe.
 
== Polimerazy u Eukariotaeukariontów ==
=== Polimerazy RNA zależne od DNA ===
U [[Eukariontyeukarionty|eukariotaeukariontów]] występuje kilka jądrowych polimeraz RNA składających się z kilkunastu (od 12 do 17) podjednostek:
* Polimeraza RNA I (Pol I) syntetyzuje pre-[[rRNA]] 45S, z którego powstają 28S, 18S i 5.8S rRNA, wchodzące w skład [[rybosom]]u. Zlokalizowana jest w [[jąderko|jąderku]].
* Polimeraza RNA II (Pol II) transkrybuje geny tworzące białka tworząc [[pre-mRNA]]. Syntezuje większość [[snRNA]] i małe jąderkowe RNA<ref name="kawiak">{{cytuj książkę | imię = Maciej | nazwisko = Zabel | imię2 = Jerzy | nazwisko2 = Kawiak | tytuł = Seminaria z Cytofizjologii | wydawca = Urban & Partner | miejsce = Wrocław | rok = 2002 | isbn = 978-83-87944-62-9}}</ref>,
* Polimeraza RNA IV jest specyficzna dla roślin (bierze udział w tworzeniu [[siRNA]] zaangażowanych w zależną od RNA [[Metylacja DNA|metylację DNA]], wyciszanie transkrypcji i formowanie [[heterochromatyna|heterochromatyny]]
 
Jądrowe polimerazy RNA [[Eukarionty|eukariota]]eukariontów – w przeciwieństwie do polimerazy RNA bakterii – potrzebują do rozpoczęcia transkrypcji zestawu podstawowych [[czynnik transkrypcyjny|czynników trankrypcyjnychtranskrypcyjnych]] ([[kompleks preinicjacyjny]]), ponieważ rozpoznają nie sekwencję promotora, ale kompleks [[Kwasykwasy nukleinowe|kwas nukleinowy]]-[[Białka|białko]]–białko.
 
Ponadto u eukariota istnieją polimerazy RNA specyficzne dla [[mitochondrium|mitochodriówmitochondriów]] i [[chloroplast]]ów.
 
Polimerazy mitochondrialne są kodowane przez [[genom]] jądrowy, charakteryzują się znaczną homologią do polimeraz [[bakteriofag]]ów z rodziny T3/T7 i zbudowane są z jednej podjednostki. Alternatywny transkrypt [[gen]]ugenu kodującego ludzką polimerazę mitochondrialną daje jądrowo-specyficzną polimerazę RNA, która odpowiada za transkrypcję niektórych [[mRNA]].
 
W chloroplastach roślin wyższych występują dwa rodzaje polimeraz. Polimeraza pierwszego rodzaju (PEP) jest homologiczna do polimeraz bakteryjnych, a jej podjednostki kodowane są przez genom chloroplastów (z wyjątkiem podjednostek sigma (σ), kodowanych przez genom jądrowy). Polimeraza drugiego rodzaju (NEP) jest homologiczna do polimeraz bakteriofagów, składa się z jednej podjednostki, i jest kodowana przez genom jądrowy.
 
=== Polimerazy RNA zależne od RNA ===
U roślin występują też polimerazy RNA zależne od RNA, które biorą udział w odpowiedzi na infekcje [[Wirusy|wirusami]] i [[wiroid]]ami, oraz w normalnych procesach rozwoju roślin, wykorzystując mechanizm [[Interferencja RNA|interferencji RNA]].
 
=== Polimerazy poli(A) ===
U eukariota występują też niezależne od DNA polimerazy poli(A). Uczestniczą one w procesach obróbki posttranskrypcyjnejpotranskrypcyjnej transkryptów Pol II. Dobudowują na końcu 3' cząsteczki RNA niekodowane reszty adeniny, układające się w ciągi oligo- lub poli(A). Proces ten nazywamy [[poliadenylacja|poliadenylacją]].
U drożdży zidentyfikowano dwie takie polimerazy: Pap1 i Trf4. Pap1 dodaje do prekursorów [[mRNA]] ogon poli(A), który stabilizuje cząsteczkę, tj.to znaczy zabezpiecza przed degradacją przez egzonukleazy 3'→5'. Trf4 natomiast, działając w kompleksie TRAMP, poliadenyluje niekodujące RNA, m.in. [[snoRNA]] i transkrypty CUT, co stymuluje ich egzonukleolizę od końca 3'. W przypadku snoRNA jest to etap dojrzewania cząsteczki, natomiast w przypadku CUT prowadzi do natychmiastowej i całkowitej degradacji transkryptu.
 
== Polimerazy u Archeaarcheonów ==
U [[Archeonyarcheony|Archeaarcheonów]] występuje jedna polimeraza RNA składająca się z 13 podjednostek o dużej homologii do podjednostek eukariotycznych polimeraz RNA (a zwłaszcza polimerazy RNA II). Podobnie jak eukariotyczne polimerazy RNA potrzebuje do rozpoczęcia transkrypcji obecności [[Ogólne czynniki transkrypcyjne|ogólnych czynników transkrypcyjnych]].
 
== Polimerazy u wirusów ==
Wiele [[Wirusy|wirusów]] posiada własne polimerazy RNA. Są wśród nich polimerazy RNA zależne od DNA i polimerazy RNA zależne od RNA. Polimeraza RNA bakteriofaga T7 składa się z jednej podjednostki i jest podobna do polimeraz mitochondrialnych i chloroplastowych. Charakteryzuje się też znaczną homologią do [[polimeraza DNA|polimerazy DNA]].
 
== BibliografiaZobacz też ==
* [[primazaprymaza]]
* [http://www.sciencedirect.com/science/article/B6VS6-452VM6X-H/2/e5356461de07ae489ee18a5201195702 Cramer P, Multisubunit RNA polymerases, COiSB 2002, Vol12(1), 89-97]
* [[Mediatormediator (biologia)|mediator]]
* [http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TD1-4J84T2D-3/2/495d2b08d8be120f2e094712fbf421fb Wassenegger M, Krczal G, Nomenclature and functions of RNA-directed RNA polymerases, TiPS 2006, Vol11(3), 142-151]
 
== Przypisy ==
{{Przypisy}}
 
== Zobacz teżBibliografia ==
* [http://www.sciencedirect.com/science/article/B6VS6-452VM6X-H/2/e5356461de07ae489ee18a5201195702 Cramer P, Multisubunit RNA polymerases, COiSB 2002, Vol12(1), 89-97]
* [[primaza]]
* [http://www.sciencedirect.com/science/article/B6TD1-4J84T2D-3/2/495d2b08d8be120f2e094712fbf421fb Wassenegger M, Krczal G, Nomenclature and functions of RNA-directed RNA polymerases, TiPS 2006, Vol11(3), 142-151]
* [[Polimerazy|polimeraza]]
* [[polimeraza DNA]]
* [[Mediator (biologia)]]
 
== Linki zewnętrzne ==
* [http://www.omim.org/entry/601778 OMIM –Mitochondrialna polimeraza mitochondrialnaRNA] {{lang|en}}, OMIM
 
[[Kategoria:Transferazy]]
25 535

edycji