Cmentarz Motolski powstał jako nekropolia pochówków urnowych przy [[Krematorium Motol|krematorium w Motolu]]. Pierwszy projekt krematorium z 1937 nie został zrealizowany, pod koniec lat 40-tych. władze miasta powróciły do porzuconego tematu. W 1951 rozpoczęto realizację projektu Josefa Karela Říhy, w 1954 ukończono budowę spopielarni zwłok oraz ulokowanego na wzgórzu leśnego cmentarza urnowego. Znajduje się on w parku przyrody Košíře-Moto, przez jego teren przepływa Potok Motolski, a nad sztucznym stawem znajduje się [[Ogród pamięci|ogrodem pamięci]].
W latach 50-tych. w zbiorowych mogiłach grzebano prochy ofiar terroru komunistycznego, po ujawnieniu tego faktu Konfederacja Więźniów Politycznych Republiki Czeskiej doprowadziła do budowy pomnika-mauzoleum upamiętniającego zamordowanych. Jego uroczyste otwarcie miało miejsce w dniu 20 maja 2000, uczestniczyli w nim przedstawiciele Konfederacji Więźniów Politycznych Republiki Czeskiej, urzędnicy państwowi, przedstawicieli miasta Pragi oraz liczni byli więźniowie
