Król przygotowującPrzygotowując się do kolejnej wojny z Moskwą, polował w Puszczy Molawickiej - w [[Parafia Narodzenia Najświętszej Maryi Panny w Kundzinie|KUNDZINIE]], wale którym na początku grudnia 1586 roku – wpo nagłej chorobie - został opatrzony ostatnimi sakramentami – przed przewiezieniemprzewieziony do pobliskiego Grodna, gdzie wkrótce zmarł 12 grudnia 1586 r.<ref>{{Cytuj |autor = Leonard Drożdżewicz |tytuł = BATORY W KUNDZINIE, „Znad Wilii”, nr 3 (63) z 2015 r., s. 23-24., 2015. |data = }}</ref> Stefan Batory zmarł prawdopodobnie na [[Przewlekła choroba nerek|mocznicę]], będącą schyłkowym stadium [[Wielotorbielowatość nerek|zwyrodnienia wielotorbielowatego nerek]], co potwierdza sekcja zwłok<ref>[http://web.archive.org/web/20160304190709/http://portalwiedzy.onet.pl/220663,4,1,0,galeria_media.html Na to umierali polscy królowie.]</ref><ref>{{Cytuj stronę |url = http://web.archive.org/web/20160304200554/http://www.zwoje-scrolls.com/zwoje32/text22p.htm |tytuł = Król Stefan zmarł nagle |nazwisko = Stypułkowska |imię = Aleksandra |data = 31 października 1965 |praca = Na Antenie (Wiadomości) 44/1022 |język = pl |data dostępu = 2015-11-18}}</ref>. Został pochowany w [[Groby Królewskie na Wawelu|katedrze wawelskiej]] w Krakowie. Po nim królem polskim został obrany [[Zygmunt III Waza]] (1587–1632). W 1877 roku trumna ze szczątkami Stefana Batorego została otworzona. Znaleziono w niej [[Polskie insygnia koronacyjne|regalia królewskie]] oraz [[Szabla|szablę]] należącą do króla{{odn|Gloger t. III|1902|s=43}}. Według wywodu dr. [[Herman Zdzisław Scheuring|Hermana Zdzisława Scheuringa]], przedstawionego w jego książce pt. ''Czy królobójstwo? Krytyczne studium o śmierci króla Stefana Wielkiego Batorego'' (1964), władca zmarł w wyniku otrucia dokonanego przez lekarzy cudzoziemców i innowierców<ref>{{Cytuj pismo | autor = Zofia Scheuring | tytuł = Ogłoszenie | czasopismo = [[Wiadomości (tygodnik emigracyjny)|Wiadomości]] | wolumin = Nr 2 (980) | strony = 2 | data = 10 stycznia 1965 | url = http://kpbc.umk.pl/publication/4439}}</ref><ref>{{Cytuj pismo | autor = [[Zofia Kozarynowa]] | tytuł = Tajemnicza śmierć Stefana Batorego | czasopismo = [[Wiadomości (tygodnik emigracyjny)|Wiadomości]] | wolumin = Nr 31 (1061) | strony = 2 | data = 31 lipca 1966 | url = http://kpbc.umk.pl/publication/4002}}</ref>.
