Słowo „Jantar” pochodzi od litewskiego odpowiednika słowa bursztyn. Pierwsze informacje o miejscowości odnaleźćzostały możnaodnotowane w 1400 roku w księdze [[Komturzy malborscy|Komturstwa Malborskiegomalborskiego]] z 1391 roku. W Jantarzeosadzie zlokalizowane były dwie karczmy. Na początku XIV wieku mieszkańcy uczestniczyli w zakładaniu organizacji przeciwpowodziowej – Związku Wałowego. W czasie [[Wielka wojna|wielkiej wojny]] [[1409]]-[[1411]] Jantar został kompletnie ograbiony i zdewastowany przez wojska oblegające [[MalborkZamek w Malborku|zamek w Malborku]]. Po II Pokoju toruńskim wieś stała się własnością miasta Gdańska. W 1903 roku utworzona została publiczna Szkoła Powszechna z sześcioma klasami. W 1945 roku nadano miejscowości nazwę Paców, by w 1947 zmienić ją na Jantar. W 1945 roku założono Szkołę Podstawową. [[podział administracyjny Polski 1975-1998|W latach 1975-1998]] miejscowość administracyjnie należała do [[województwo elbląskie|województwa elbląskiego]].
