Na czele Straży stoiistoi Dyrektor Generalny (który odpowiada swoją rangą wiceadmirałowi w marynarce), jego zastępcą jest Inspektor Generalny. Straż podporządkowana jest Ministerstwu Obrony Indii. W momencie wybuchu wojny Straż przechodzi pod rozkazy marynarki wojennej. Obszar działania służby podzielony jest na trzy Regiony Morskie a każdy z nich na Obszary Morskie. W sumie jest jedenaście obszarów. Dodatkowo dowództwom obszarów morskich podlegają cztery samodzielne placówki Straży Wybrzeża. Siły powietrzne Straży zorganizowane są w dwa obszary powietrzne i trzy placówki powietrzne podlegające bezpośrednio dowództwom regionów morskich. Kwatera główna Straży mieści się w [[New Delhi]]. Obecnie siły liczą 5440 ludzi w tym 633 oficerów.