Filogenomika: Różnice pomiędzy wersjami

[wersja przejrzana][wersja przejrzana]
Usunięta treść Dodana treść
m drobne redakcyjne, drobne techniczne
Poprawiono link
Linia 1:
'''Filogenomika'''<ref>{{Cytuj pismo | nazwisko = Mackiewicz | imię = Paweł |nazwisko2 = Zakrzewska-Czerwińska | imię2 = Jolanta|nazwisko3 = Cebrat | imię3 = Stanisław | tytuł = Genomika – dziedzina wiedzy XXI wieku | czasopismo = Biotechnologia | wolumin = 3| wydanie = 70| strony = 7-21 | miesiąc = | rok = 2005 | doi = | pmid = |url = http://www.pfb.p.lodzinfo.pl/dlfiles/kwartalnik/3_2005/2005_03_03Mackiewicz-Zakrzewska.pdf}}</ref> – dziedzina [[nauka|nauki]] będąca połączeniem wiedzy z [[ewolucja|ewolucji]] i [[genomika|genomiki]]<ref>{{cytuj pismo |tytuł = Overview of the First Phylogenomics Conference | nazwisko = Philippe| imię = Hervé| | nazwisko2 = Blanchette| imię2 = Mathieu | rok = 2007 | czasopismo = BMC Evolutionary Biology |wolumin=7 |wydanie=Suppl 1 |strony=S1| język = en |doi=10.1186/1471-2148-7-S1-S1}}</ref>. Termin ten był używany w wielu znaczeniach do określenia niektórych typów analiz z udziałem danych [[genom]]u i rekonstrukcji ewolucyjnych, zwłaszcza [[filogeneza|filogenezy]]. Przykłady różnych znaczeń filogenomiki:
* Przewidywanie funkcji [[gen]]u w oparciu o historię jego ewolucji w [[drzewo filogenetyczne|drzewie filogenetycznym]]. Było to pierwotne znaczenie tego terminu, użytego przez biologa ewolucyjnego Jonathana Eisena. W celu przeglądu tego aspektu filogenomiki, patrz: Sjölander (2004)<ref>{{Cytuj pismo | nazwisko = Sjölander | imię = K. | tytuł = Phylogenomic inference of protein molecular function: advances and challenges | czasopismo = Bioinformatics | wolumin = 20 | wydanie = 2 | strony = 170-9 | rok = 2004 | doi = | pmid = 14734307 |język=en}}</ref> oraz Brown i Sjölander (2006)<ref>{{Cytuj pismo | nazwisko = Brown | imię = D. | nazwisko2 = Sjölander | imię2 = K. | tytuł = Functional classification using phylogenomic inference | czasopismo = PLoS Computational Biology | wolumin = 2 | wydanie = 6 | strony = e77 | rok = 2006 | doi = 10.1371/journal.pcbi.0020077 | pmid = 16846248 |język=en}}</ref>.
* Rekonstrukcja drzewa [[gatunek (biologia)|gatunku]] przez połączenie informacji z wielu genów lub całego genomu<ref>{{Cytuj pismo | nazwisko = Delsuc | imię = F. | nazwisko2 = Brinkmann | imię2 = H. | nazwisko3 = Philippe | imię3 = H. | tytuł = Phylogenomics and the reconstruction of the tree of life | czasopismo = Nature Review Genetics | wolumin = 6 | wydanie = 5 | strony = 361-75 | rok = 2005 | doi = 10.1038/nrg1603 | pmid = 15861208 |język=en}}</ref><ref>{{Cytuj pismo | nazwisko = Philippe | imię = H. | nazwisko2 = Snell | imię2 = EA. | nazwisko3 = Bapteste | imię3 = E. | nazwisko4 = Lopez | imię4 = P. | nazwisko5 = Holland | imię5 = PW. | nazwisko6 = Casane | imię6 = D. | tytuł = Phylogenomics of eukaryotes: impact of missing data on large alignments | czasopismo = Molecular Biology and Evolution | wolumin = 21 | wydanie = 9 | strony = 1740-52 | rok = 2004 | doi = 10.1093/molbev/msh182 | pmid = 15175415 |język=en}}</ref><ref>{{Cytuj pismo | nazwisko = Jeffroy | imię = O. | nazwisko2 = Brinkmann | imię2 = H. | nazwisko3 = Delsuc | imię3 = F. | nazwisko4 = Philippe | imię4 = H. | tytuł = Phylogenomics: the beginning of incongruence? | czasopismo = Trends in Genetics | wolumin = 22 | wydanie = 4 | strony = 225-31 | rok = 2006 | doi = 10.1016/j.tig.2006.02.003 | pmid = 16490279 |język=en}}</ref>