Sekwencjonowanie DNA: Różnice pomiędzy wersjami
[wersja przejrzana] | [wersja przejrzana] |
Usunięta treść Dodana treść
jęz. |
poprawa linków, drobne merytoryczne, drobne redakcyjne, drobne techniczne |
||
Linia 1:
{{Dopracować|aktualizacja=2018-09}}
'''Sekwencjonowanie DNA''' – technika odczytywania [[sekwencja|sekwencji]], czyli kolejności [[para zasad|par nukleotydowych]] w cząsteczce [[Kwas deoksyrybonukleinowy|DNA]].
Linia 10 ⟶ 11:
[[Plik:Sanger-DNA-seq.png|thumb|300px|Sekwencjonowania DNA metodą Sangera z użyciem znakowanych dideoksynukleotydów<br />'''A''' – przykładowa sekwencja DNA<br />'''B''' – przyłączenie startowego [[Oligonukleotydy|oligonukleotydu]] do nici matrycowej i kierunek syntezy DNA<br />'''C''' – produkty syntezy DNA, zakończone [[fluorescencja|fluorescencyjnie]] znakowanymi dideoksynukleotydami (kolorowe litery)<br />'''D''' – elektroforegram rozdziału otrzymanej mieszaniny fragmentów w [[elektroforeza#Elektroforeza kapilarna|elektroforezie kapilarnej]] wraz z zidentyfikowaną sekwencją (powyżej)]]
[[Plik:Pyrogram1.jpg|thumb|300px|Przykładowy pirogram uzyskany z pirosekwencjonowania]]
Historyczną już i wypieraną metodą jest opracowana w
Autorem alternatywnej metody sekwencjonowania DNA, z wykorzystaniem specyficznej, chemicznej degradacji DNA, byli [[Walter Gilbert]] i [[Allan Maxam]] ([[metoda Maxama-Gilberta]])<ref>
== Metody współczesne ==
Obecnie odczyt sekwencji w metodzie Sangera został zautomatyzowany dzięki wykorzystaniu znakowanych [[fluorescencja|fluorescencyjnie]] trifosforanów dideoksynukleotydów i pozwala na odczyt
Nowoczesne (2013) aparaty do sekwencjonowania DNA są w stanie pracować z szybkością rzędu milionów [[para zasad|par zasad]] dziennie<ref>{{Cytuj książkę|nazwisko = Soh J., Gordon P., Sensen C.|imię = |tytuł = Genome Annotation|rok = 2013|wydawca = Chapman & Hall/CRC|miejsce = |strony = 1|isbn = 978-1-4398-41174|url={{Google Books|PKfMBQAAQBAJ|Genome Annotation|strony=1|link=tak}}}}</ref>. [[tranzystor polowy DNA|Tranzystory polowe DNA]] umożliwiają użycie natywnego DNA w hybrydyzacji do [[Mikromacierz DNA|mikromacierzy]] i odczyt w czasie rzeczywistym.
Nagroda [[X
Nowoczesne metody sekwencjonowania DNA są na tyle tanie, iż setki tysięcy osób zapłaciły za zbadanie swojego DNA i wzięły udział w [[Projekt Genograficzny|Projekcie Genograficznym]]. Ta względna taniość umożliwiła również rozwój m.in. [[genetyka genealogiczna|genetyki genealogicznej]] oraz wielu rodzajów badań testujących obecność [[
== Metody rozwojowe ==
* [[pirosekwencjonowanie]]; jego wersja "sekwencjonowanie 454" pozwala odczytać 300 MBp na dzień w jednej maszynie. Metoda ta jest szczególnie przydatna do sekwencjonowania [[Antyczny DNA|aDNA]].
* bezpośredniego odczytu{{fakt|data=2007-08}}:
** nanosekwencjonowanie. Przesuwająca się cząsteczka DNA poprzez centrum aktywne modyfikowanych polimeraz jest odczytywana bezpośrednio.
** mikroskopowe
== Historia rozwoju metod sekwencjonowania DNA ==
*
*
*
*
*
** [[Andre Marion]] i [[Samuel Eletr]] utworzyli firmę ''[[Applied Biosystems]]'', która w tym okresie zdominowała automatyczne sekwencjonowanie DNA
*
*
*
*
*
== Zobacz też ==
|