Interferencja RNA: Różnice pomiędzy wersjami

[wersja przejrzana][wersja przejrzana]
Usunięta treść Dodana treść
Paweł Ziemian BOT (dyskusja | edycje)
m Dodaję nagłówek przed Szablon:Przypisy
Linia 10:
 
== Mechanizm ==
Małe interferujące RNA (siRNA) powstają przez pocięcie obcego dwuniciowego RNA (np. wirusowego) na krótkie kawałki (21-25 [[para zasad|par zasad]]) przez białko Dicer, natomiast miRNA powstają jako długie cząsteczki prekursorowego miRNA [[transkrypcja (genetyka)|transkrybowane]] z DNA komórki na RNA przez [[polimeraza RNA|polimerazę RNA]] II (tę samą, która bierze udział w transkrypcji [[mRNA]]). Ocenia się, że miRNA biorą udział w regulacji 30% ludzkich [[gen]]ów. Następnie kompleks białkowy określany jako mikroprocesor rozpoznaje powstające w transkrypcie pre-miRNA struktury szpilki do włosów i tnie cząsteczkę na fragmenty o długości ok. 65 [[Nukleotydy|nukleotydów]]. Składają się one z dwuniciowego fragmentu o długości około 22 par zasad, na którego jednym końcu znajduje się jednoniciowa pętelka, a na drugim króciutki jednoniciowy kawałek. Taka szpilka RNA jest transportowana do [[cytoplazma|cytoplazmy]], gdzie Dicer przycina ją do odpowiedniej długości (likwidując też pętelkepętelkę).
 
Odpowiedniej długości miRNA i siRNA wiążą się z kompleksem białkowym o aktywności [[endorybonukleaza|endorybonukleazy]] zwanym [[RISC (genetyka)|RISC]] (ang. ''RNA-induced silencing complex'' – indukowany przez RNA kompleks wyciszający). Cząsteczki RNA rozwijają się, a następnie kierują kompleks RISC do komplementarnych cząsteczek mRNA. siRNA są idealnie komplementarne do mRNA i w takim przypadku jeden ze składników RISC – białko Argonauta – przecina cząsteczkę mRNA. Jeśli cząsteczki nie wykazują się 100% homologią, jak to jest w przypadku miRNA, mRNA ulega strawieniu przez endorybonukleazy, lub następuje represja [[translacja (genetyka)|translacji]] tego mRNA. U roślin miRNA charakteryzują się zwykle wyższą homologią do docelowej sekwencji i indukują przecinanie mRNA przez RISC, a u zwierząt homologia miRNA do docelowego genu jest niższa, przez co powodują one represję translacji docelowego mRNA<ref name="Saumet-2006">{{Cytuj pismo | nazwisko = Saumet | imię = A. | nazwisko2 = Lecellier | imię2 = CH. | tytuł = Anti-viral RNA silencing: do we look like plants? | czasopismo = Retrovirology | wolumin = 3 | numer = | strony = 3 | miesiąc = | rok = 2006 | doi = 10.1186/1742-4690-3-3 | pmid = 16409629 }}</ref>. Wydaje się, że represja translacyjna polega na blokowaniu inicjacji translacji przez miRNA. Związanie się miRNA z docelowym transkryptem nie pozwala na łączenie się podjednostek [[rybosom]]u na tym mRNA, zapewne za pomocą białka eIF6<ref name="Chendrimada-2007">{{Cytuj pismo | autor=Chendrimada TP, Finn KJ, Ji X, Baillat D, Gregory RI, Liebhaber SA, Pasquinelli AE, Shiekhattar R | tytuł = MicroRNA silencing through RISC recruitment of eIF6. | czasopismo = Nature | wolumin = 447 | numer = 7146 | strony = 823-8 | rok = 2007 | doi = 10.1038/nature05841 | pmid = 17507929 }}</ref>. Ponadto blokadzie inicjacji translacji ulegają tylko transkrypty, w których inicjacja translacji jest zależna od [[Czapeczka (genetyka)|czapeczki]], co sugeruje udział w tym mechanizmie [[czynniki inicjacji translacji|czynnika inicjacji translacji]] eIF4E, który wiąże czapeczkę<ref name="Jackson-2007">{{Cytuj pismo | nazwisko = Jackson | imię = RJ. | nazwisko2 = Standart | imię2 = N. | tytuł = How do microRNAs regulate gene expression? | czasopismo = Sci STKE | wolumin = 2007 | numer = 367 | strony = re1 | rok = 2007 | doi = 10.1126/stke.3672007re1 | pmid = 17200520 }}</ref>.