[[Plik:MiniPCI and MiniPCI Express cards.jpg|thumb|240px|Porównanie kart na miniPCI i miniPCIe]]
Istnieje kilka wariantów łącza PCI Express – z 1, 2, 4, 8, 12 lub 16 liniami (ang. ''lanes''). Wraz ze zwiększaniem się liczby dostępnych linii wzrasta rzeczywista długość [[slot|złącza]] (ang. ''slot''), a poprzez wspólną część początkową i dodawanie nowych linii na końcu złącza, jego konstrukcja umożliwia działanie kart wolniejszych (z mniejszą liczbą linii) niż te, które maksymalnie obsługuje gniazdo. Sytuacja odwrotna, czyli montaż karty przygotowanej na obsługę większej liczby linii w gnieździe o mniejszej ich liczbie, może nie być możliwa ze względu na ograniczenie przepustowości albo też może wymagać fizycznej modyfikacji karty lub złącza. Gniazdo x1 ma 18 pinów z każdej strony, gniazdo x4 – 32, gniazdo x8 – 49, zaś gniazdo x16 – 82 piny z każdej ze stron.
Specyfikacja PCIe określa również karty o mniejszych rozmiarach, takie jak:
