W 1992 rozpoczął się proces prywatyzacji instytutu. Poza MCST, współpracującym z Sun Microsystems, w 1997 powstała firma ''Elbrus International''<ref name="thocp">{{Cytuj stronę | url = https://www.thocp.net/biographies/babaian_boris.htm | tytuł = Boris Artashegovich Babaian | praca = The History of Computing Project | język = en | data dostępu = 2017-06-27}}</ref>.
W 1999 Elbrus ogłosił swoje prace nad komputerem ''Elbrus 2000'' – odmianą ''Elbrusa-3'' na jeden [[układ scalony]]. Miał on być trzykrotnie szybszy od projektowanego ówcześnie przez firmę [[Intel]] procesora [[Itanium|Merced]]<ref name="$$$">{{Cytuj pismo | nazwisko = Lettice | imię = John | tytuł = Ex-Soviets seek $$$ for Merced-killer – Transmeta linked? | czasopismo = The Register | język = en | data = 1999-02-25 | url = https://www.theregister.co.uk/1999/02/25/exsoviets_seek_for_mercedkiller_transmeta/ | data dostępu = 2017-06-27}}</ref>. Firmie nie udało się jednak zebrać środków potrzebnych na produkcję prototypu. Babajan mówił, że potencjalni inwestorzy „boją się konkurować z Intelem”<ref name="future">{{Cytuj pismo | nazwisko = Magee | imię = Mike | tytuł = Russian chip scientist Babaian outlines Elbrus future | czasopismo = The Register | język = en | data = 1999-04-01 | url = https://www.theregister.co.uk/1999/04/01/russian_chip_scientist_babaian_outlines/ | data dostępu = 2017-06-27}}</ref><ref>{{Cytuj pismo | nazwisko = Lettice | imię = John | tytuł = Russian wannabe Merced-killer claims Transmeta credit | czasopismo = The Register | język = en | data = 2000-01-21 | url = http://www.theregister.co.uk/2000/01/21/russian_wannabe_mercedkiller_claims_transmeta/ | data dostępu = 2017-06-27}}</ref>.
