Biblioteka genomowa: Różnice pomiędzy wersjami
| [wersja nieprzejrzana] | [wersja nieprzejrzana] |
Usunięta treść Dodana treść
m poprawa linków |
W zależności od zastosowanego systemu wektorowego banki genów mogą być różnej wielkości. Na wielkość b.g. wpływa pojemność klonująca systemu wektorowego. B.g. jest tym większy im bardziej skomplikowan |
||
Linia 3:
Powstaje przez pocięcie całego [[genom|genomu]] danego organizmu [[enzymy restrykcyjne|enzymami restrykcyjnymi]], a następnie połączenie powstałych w ten sposób fragmentów DNA z [[Wektor genetyczny|wektorami]] (np. [[plazmid|plazmidami]] lub [[kosmid|kosmidami]]), tak że każdy wektor zawiera jeden, losowo wybrany fragment. Wektory te następnie wprowadza się do komórek bakteryjnych (np. bakterii [[pałeczka okrężnicy|''Escherichia coli'']]) - każda bakteria pobiera jeden wektor, a więc zawiera jeden fragment oryginalnego genomu. Taka bakteria, namnażając się, tworzy [[klon]] bakteryjny zawierający ten fragment. Tylko niektóre klony zawierają [[gen]]y, część zawiera tylko fragmenty genów, większość sekwencje niekodujące. Fragmenty DNA niesione przez dwa klony mogą nakładać się na siebie, gdyż powstały przez losowe cięcie wielu kopii oryginalnego genomu. Biblioteka genomowa powinna być odpowiednio duża, aby prawdopodobieństwo, że ''każdy'' fragment oryginalnego genomu jest w niej obecny, wynosiło co najmniej 99%.
W zależności od zastosowanego systemu wektorowego banki genów mogą być różnej wielkości. Na wielkość b.g. wpływa pojemność klonująca systemu wektorowego. B.g. jest tym większy im bardziej skomplikowany jest organizm. Jest on konstruowany w sposób dość przypadkowy.
Wzór Clarka&Carbona jest wykorzystywany do określenia liczby koniecznych (wymaganych) rekombinantów (klonów):
N=ln(1-P)/nl[1-(L-x/M)]
gdzie:
N-liczba wymaganych klonów
P- prawdopodobieństwo z jakim jesteśmy w stanie znaleźć w danym banku dany gen
L- długość klonowanego fragmentu
x- wielkość szukanego genu
M- wielkość genomu
== Rodzaje bibliotek genomowych ==
# Biblioteki [[plazmid|plazmidowe]]: Pojemność 10kb
| |||