Lokomotiw Moskwa został założony w 1923 roku jako ''KOR Moskwa'' (''Клуб Октябрьской Революции'', Klub Rewolucji Październikowej), w 1931 roku jego dotychczasową nazwę zmieniono na ''Kazanka'' (od nazwy dworca[[Moskwa|moskiewskiego]] kolejowego[[Dworzec Kazański (Moskwa)|Dworca Kazańskiego]]), zaś w 1936 na Lokomotiw (tzn. "Lokomotywa", nazwa jest związana z tym że to był klub resortowy ministerstwa transportu kolejowego; temu tradycyjnie zawodnicy klubu są nazywani "kolejarze"). W czasach [[Związek Socjalistycznych Republik Radzieckich|Związku Radzieckiego]] klub występował w Pierwszej i Drugiej Dywizji (2. i 3. liga), nigdy nie udało mu się awansować do najwyższej klasy rozgrywkowej. Sukcesy odnosił jedynie w krajowym pucharze, który zdobył dwukrotnie. Zupełnie inaczej potoczyły się losy klubu po rozpadzie imperiumZwiązku Radzieckiego. Od początku istnienia [[Priemjer-Liga|Rosyjskiej Premier Ligi]] Lokomotiw nie zajął miejsca niższego niż szóste. W 2002 roku przerwał dominację [[Spartak Moskwa (piłka nożna)|Spartaka Moskwa]] i zdobył mistrzostwo kraju. Reprezentował Rosję w [[Liga Mistrzów UEFA|Lidze Mistrzów]] i [[Liga Europy UEFA|Pucharze UEFA]]. W 2004 roku ponownie wygrał [[Priemjer-Liga|Premier Ligę]], wyprzedzając o punkt [[CSKA Moskwa (piłka nożna)|CSKA Moskwa]]. W 2005 roku wieloletni trener Lokomotiwu [[Jurij Siomin]] został selekcjonerem [[Reprezentacja Rosji w piłce nożnej|reprezentacji Rosji]] i zastąpił go Władimir Esztrekow. Przez długi czas w sezonie 2005 klub prowadził w tabeli, jednak ostatecznie został wyprzedzony zarówno przez [[CSKA Moskwa (piłka nożna)|CSKA]], jak i przez stołeczny Spartak, kwalifikując się jedynie do Pucharu UEFA. Klub ten ma najwięcej obcokrajowców w zespole w klubie z Rosji, bo aż 19.
