Podstawowym walorem rezerwatu jest fragment lasu z udziałem [[Jodła pospolita|jodły pospolitej]] w składzie drzewostanu na siedliskach grądu subkontynentalnego (''(Tilio-Carpinetum)'') i kontynentalnego boru mieszanego (''(Querco-Pinetum)''). Na uwagę zasługują też wartościowe drzewostany z udziałem wiekowej [[sosna pospolitazwyczajna|sosny pospolitejzwyczajnej]] i [[dąb szypułkowy|dębu szypułkowego]]. Aktualnie udział jodły w drzewostanach rezerwatu jest znikomy – rzadko wchodzi w skład drzewostanów, występując najczęściej pojedynczo lub miejscami osiągając maksymalnie 40%-owy udział w składzie drzewostanów. Rzadko spotykana jest także w niższych warstwach. Na terenie rezerwatu gatunek ten odnawia się stosunkowo słabo, jedynie w niektórych oddziałach leśnych. Brak jest ciągłości pokoleniowej gatunku poprzez brak drugiego piętra i [[podrost]]u z udziałem jodły, co może wskazywać, iż siewki jodły przegrywają konkurencję z typowymi gatunkami grądowymi, zwłaszcza z [[Grab pospolity|grabem]]<ref name=":0" /><ref name=":1">{{Cytuj|autor=Henryk Kot|tytuł=Przyroda województwa siedleckiego|data=1995}}</ref>.
Z grupy gatunków chronionych na terenie rezerwatu wymienić występuje [[lilia złotogłów]] (''(Lilium martagon)''), liczniej natomiast reprezentowana jest grupa gatunków częściowo chronionych, spośród których na terenie rezerwatu występują: [[gnieźnik leśny]] (''(Neottia nidus-avis)''), [[miodownik melisowaty]] (''(MellitisMelittis melissophyllum)''), [[orlik pospolity]] (''(Aquilegia vulgaris)''), [[Pomocnik baldaszkowy|pomocnik baldaszkowaty]] (''Chimaphila umbellata''), [[wawrzynek wilczełyko]] (''(Daphne mezereum)''), [[Widłak goździsty|widlak goździsty]] (''(Lycopodium clavatum)''), [[turówka leśna]] (''(Hierochloë australis)'') oraz grupa gatunków rzadkich, do których należą: [[barwinek pospolity]] (''(Vinca minor)''), [[przylaszczka pospolita]] (''Hepatica nobilis''), [[bluszcz pospolity]] (''Hedera helix''), [[łuskiewnik różowy]] (''(Lathraea sequamaria)squamaria''), [[rutewka orlikolistna]] (''(Thlictrum aquilegifolium)''), [[turzyca orzęsiona]] (''(Carex pilosa)'') i [[wyka kaszubska]] (''(Vicia cassubica)'')<ref name=":1" /><ref>{{Cytuj|autor=Marek T. Ciosek, Katarzyna Piórek, Janusz Krechowski|tytuł=Interesujące gatunki roślin naczyniowych rezerwatu jodłowego "Rudka Sanatoryjna"|czasopismo=Chrońmy Przyrodę Ojczystą|wolumin=5|data=2006|url = http://panel.iop.krakow.pl/uploads/wydawnictwa_artykuly/cb39abcaa68cba2511af474d92719f9d5afd678a.pdf}}</ref>''.''
