W Sejnachmieście działa piłkarski klub sportowy Sejneński Klub Sportowy Pomorzanka, założony w1 września 1957 roku i używający barw czerwono-czarnych. Drużyna mecze rozgrywa na stadionie miejskim przy ul. Konarskiego 23A, mieszczącym 1000 widzów<ref>{{Cytuj | url=https://seniorzypomorzankasejny.futbolowo.pl/o-klubie | tytuł=Pomorzanka Sejny – informacje o klubie | opublikowany=seniorzypomorzankasejny.futbolowo.pl | data dostępu=2019-04-13}}</ref>. Trenerem jest Wojciech Milewski. Obecnie Pomorzanka Sejny występuje w klasie okręgowej w grupie podlaskiej. Posiada drużyny młodzieżowe: juniorów młodszych, żaków i orlików. W swojej historii klub używał nazw:
* 1955 – 1957 – Pogoń Sejny
* IV 1958 – VI 1959 – Iskra Sejny (w prasie jako Pogoń)
* VII 1959 – 1966 – LZS Sejny (Ludowy Zespół Sportowy)
* 1966/1967 – LKS Sejny (Ludowy Klub Sportowy)
* 1967/1968 – MLKS Pomorzanka Sejny (Międzyzakładowy Ludowy Klub Sportowy)
* 2004 – SKS Pomorzanka Sejny (Sejneński Klub Sportowy)
