W leczeniu niepłodności kobiet z PCOS poza zmianą stylu życia i metforminametforminą stosuje się lek pobudzający [[owulacja|owulację]] - [[clomifen]]<ref name="met-clo"/>. Clomifen stosowany w monoterapii pobudza owulację również u kobiet nie cierpiących na PCOS. Badania wykazują, że w przywracaniu jajeczkowania u pacjentek z wielotorbielowatymi jajnikami clomifen jest tak samo skuteczny jak metformina, jednak jednoczesne leczenie clomifenem i metforminą okazało się skuteczniejsze niż sama metformina<ref>{{Cytuj pismo| autor = Palomba S, Pasquali R, Orio F, Nestler J E. | tytuł = Clomiphene citrate, metformin or both as first-step approach in treating anovulatory infertility in patients with polycystic ovary syndrome (PCOS): a systematic review of head-to-head randomized controlled studies and meta-analysis. |pismo= Clinical Endocrinology | rok= 2009|wolumin: 70(2)| strony= 311-321}}</ref>.
Kobietom, u których doustne leki nie wywołują oczekiwanych rezultatów, zaleca się operację [[laparoskopia|laparoskopowego]] usuwania części jajników.
