Cytochrom b jest zbudowany z 8 wewnątrz błonowych helis. Zawiera dwa [[kofaktory|kofaktory]] - hemy b (wysoko potencjałowy hem b<sub>H</sub> i nisko potencjałowy hem b<sub>L</sub>), które są niekowalencyjnie związane z białkiem. Ligandami dla obu hemów są cztery konserwatywne reszty histydyny (po dwie na każdy kofaktor). Cytochrom b zawiera miejsce redukcji [[ubichinon|chinonów]] (miejsce Q<sub>i</sub>), które znajduje się po negatywnej stronie błony oraz współtworzy, wraz z białkiem Rieskiego, miejsce utleniania [[ubichinon|hydrochinonów]] (miejsce Q<sub>o</sub>).
W cytochromie b<sub>6</sub>f w miejscu cytochromu b znajdują się dwie podjednostki, cytochrom b<sub>6</sub> i [[podjednostka IV|podjednostka IV]]. Cytochrom b<sub>6</sub> jest zbudowany z czterech wewnątrz błonowych helis i pełni podobną funkcję jak cytochrom b. Zawiera dodatkowy kofaktor, hem c przyłączony kowalencyjnie przez jedną, konserwatywną resztę cysteiny. Funkcja dodatkowego kofaktora nie jest jeszcze znana, najprawdopodobniej bierze udział w procesie cyklicznej fazy jasnej [[fotosynteza|fotosyntezy]].
==Funcja==
Główną funkcją cytochromu b/b<sub>6</sub> jest transfer elektronu pomiędzy miejscami Q<sub>o</sub> i Q<sub>i</sub>. Tym samym cytochrom b/b<sub>6</sub> jest odpowiedzialny za działanie [[cykl Q|pompy protonowej]], która generuje [[gradient elektrochemiczny|gradient protonowy]]. Transfer elektronu z hydrochinonu na hem b<sub>L</sub> jest możliwy dzięki ruchowi domeny białka Rieskiego zawierającej [[centrum żelazowo-siarkowe|centrum żelazowo-siarkowe]]. Następnie elektron przemieszcza się na hem b<sub>H</sub> skąd może zostać użyty do redukcji chinonu do semichinonu w miejscy Q<sub>i</sub>. W kolejnym cyklu semichinon redukowany jest do hydrochinonu i przechodzi do błony.
Proces redukcji chinonu i transferu elektronu zachodzący w cytochromie b/b<sub>6</sub> jest odwracalny.
