Proteomika: Różnice pomiędzy wersjami

[wersja nieprzejrzana][wersja nieprzejrzana]
Usunięta treść Dodana treść
Tsca.bot (dyskusja | edycje)
poprawki ortografii: pojedyńczy → pojedynczy
m lit.
Linia 14:
==Gałęzie proteomiki==
#''Rozdzielanie białek'' - większość badań proteomicznych nie może obejść się bez wstępnego rozdzielenia mieszaniny białek. Używane do tego metody to m.in. [[elektroforeza]] jedno- lub dwuwymiarowa oraz [[chromatografia]].
#''Identyfikacja białek'' - mało wydajną i coraz radziejrzadziej stosowaną metodą do określania sekwencji aminokwasowej białka jest [[degradacja Edmana]]. Obecnie najczęściej stosuje się metody wysokoprzepustowe oparte na [[spektrometria mas|spektrometrii mas]] w połączeniu z białkowymi bazami danych oraz programami do sekwencjonowania ''de novo''. Używa się również metod immunologicznych.
#''Ilościowe pomiary białek'' (proteomika różnicowa) - używa się w nich metod opartych na elektroforezie żelowej, z zastosowaniem różnorodnych barwników (np. [[różnicowa elektroforeza żelowa]]) lub metod opartych na [[spektrometria mas|spektrometrii mas]] i [[chromatografia|chromatografii]].
#''Analiza sekwencji białka'' - dziedzina ta jest silnie związana z [[bioinformatyka|bioinformatyką]] i przeszukiwaniem baz danych w celu znalezienia konkretnego białka lub peptydu. Obejmuje także interesujące zagadnienia przypisania funkcji poszczególnym domenom białka, przewidywania funkcji w komórce na podstawie sekwencji oraz ewolucyjnego pokrewieństwa białek.
#''Proteomika strukturalna'' - zajmuje się określaniem trójwymiarowej struktury białka. Stosowane techniki to [[Rentgenografia strukturalna|krystalografia rentgenowska]] i [[spektroskopia NMR]].
#''Proteomika interakcyjna'' - bada oddziaływania między białkami w skali atomowej, cząsteczkowej i komórkowej.
#''Badanie modyfikacji białek'' - większość białek po procesie translacji ulega dalszej modyfikacji (modyfikacja posttranslacyjna). Szczególnie intesywnieintensywnie bada się obecnie fosforylację (fosfoproteomika) i glikozylację (glikoproteomika).
 
==Główne techniki stosowane w proteomice==