Odwrotna transkrypcja: Różnice pomiędzy wersjami

[wersja przejrzana][wersja przejrzana]
Usunięta treść Dodana treść
m drobne redakcyjne, drobne techniczne
m drobne redakcyjne, drobne merytoryczne
Linia 1:
[[Plik:Reverse transcription.svg|mały|290px| Mechanizm odwrotnej transkrypcji u wirusów klasy VI ssRNA-RT, na przykładzie [[ludzki wirus niedoboru odporności|ludzkiego wirusa niedoboru odporności]] (HIV). Oznaczenia: U3 – rejon promotorowy; U5 – miejsce rozpoznawane przez wirusową integrazę; {{nowrap|PBS – miejsce}} wiążące [[starter (genetyka)|starter]]; PP – sekwencja polipurynowa; ''gag'', ''pol'', ''env'' – zobacz organizacja genomu wirusa HIV. Dobór kolorów wskazuje na sekwencje komplementarne. Diagram nie jest narysowany w skali]]
 
'''Odwrotna transkrypcja''' – proces przepisania jednoniciowego [[Kwasy rybonukleinowe|RNA]] ([[ssRNA]]) przez enzym [[odwrotna transkryptaza|odwrotną transkryptazę]] (RT) na dwuniciowy [[Kwas deoksyrybonukleinowy|DNA]]. Proces odwrotnej transkrypcji wykorzystywany jest przez niektóre [[wirusy RNA]], w tym [[Ludzki wirus niedoboru odporności|HIV]], do włączenia swojego materiału genetycznego do genomu komórek gospodarzowych i jego replikacji. Proces ten został odkryty i zbadany przez amerykańskiego onkologa [[Howard Martin Temin|Howarda Martina Temina]]. Odwrotna transkrypcja stosowana jest również w procesie odtwarzania [[telomer (genetyka)|telomerów]] przez [[telomeraza|telomerazę]],; towarzyszy też przemieszczaniu się [[retrotranspozon]]ów w [[genom]]ie gospodarzagospodarzu.
 
Reakcję odwrotnej transkrypcji wykorzystuje się do syntezy cDNA na matrycy RNA, co jest przydatne w niektórych badaniach, między innymi w [[reakcja łańcuchowa polimerazy z odwrotną transkrypcją|reakcji łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkrypcją]].
Linia 7:
== Mechanizm ==
 
Odwrotna transkrypcja wirusa HIV odbywa się w cytoplazmie komórek gospodarzowych. W tym procesie wirusowe jednoniciowe RNA (ssRNA) jest przepisywane przez odwrotną transkryptazę (RT) na dwuniciowy DNA. Odwrotna transkrypcja odbywa się w kierunku [[koniec 5′|5′]]→[[koniec 3′|3′]]. Proces rozpoczyna się, gdy [[tRNA]] wiąże się do PBS i dostarcza [[grupa hydroksylowa|grupy hydroksylowej]] (-OH) niezbędnej do inicjacji odwrotnej transkrypcji. Następnymi etapami są:
* powstanie komplementarnej DNA ([[cDNA]])
* rozkład matrycowego RNA w kompleksie RNA:DNA przez RN-azową domenę H odwrotnej transkryptazy
Linia 14:
* degradacja pozostała części matrycy ssRNA przez [[rybonukleazy|rybonukleazę]] H, z wyjątkiem sekwencji polipurynowej (miejsca PP)
* inicjacja syntezy drugiej nici ssDNA, począwszy od końca 3' matrycy (tRNA jest niezbędny do syntezy komplementarnej PBS)
* oddysocjowanie tRNA od DNA i jego degradacja przez RNazęRN-azę
* kolejny „skok” PBS z drugiej nici hybrydyzuje z komplementarnym PBS pierwszej nici ssDNA
* powstanie brakujących fragmentów obu nici dsDNA poprzez aktywność polimerazy DNA (DNAP) odwrotnej transkryptazy.