W listopadzie 2009 prokurator prokuratury okręgowaokręgowej w Poniewieżu skierował akt oskarżenia przeciwko funkcjonariuszom sowieckich organów bezpieczeństwa, którzy w 1965 brali udział w obławie na Antanasa Kraujelisa (zakończonej jego śmiercią)<ref name="delfi">{{Cytuj stronę | url = https://www.delfi.lt/news/daily/lithuania/lat-galutinai-isteisino-m-misiukoni-del-paskutinio-lietuvos-partizano-a-kraujelio-zuties.d?id=70518470 | tytuł = LAT galutinai išteisino M. Misiukonį dėl paskutinio Lietuvos partizano A. Kraujelio žūties | data = 2016-02-25 | opublikowany = delfi.lt | język = lt | data dostępu = 2019-02-10}}</ref>. Marijonasowi Misiukonisowi postawiony został zarzut udziału w [[ludobójstwo|ludobójstwie]]. Wyrokiem sądu okręgowego w Poniewieżu z 26 listopada 2014 został uniewinniony w I instancji, 7 lipca 2015 wyrok ten został utrzymany w mocy przez sąd apelacyjny w Wilnie<ref>{{Cytuj stronę | url = https://www.infolex.lt/portal/start.asp?act=news&Tema=49&str=57120 | tytuł = Apeliacinis teismas: M. Misiukonis išteisintas pagrįstai | data = 2015-07-07 | opublikowany = infolex.lt | język = lt | data dostępu = 2019-02-10}}</ref>. 25 lutego 2016, po rozpatrzeniu kasacji, Sąd Najwyższy ostatecznie uniewinnił go od zarzutu udziału w ludobójstwie<ref name="delfi"/>.
