3′UTR

3′UTR (z ang. 3′ untranslated region), rejon 3′ niepodlegający translacji – niepodlegająca translacji część mRNA położona w kierunku 3′ od sekwencji kodującej (u eukariontów między sekwencją kodującą a ogonem poli-A).

W obszarze 3′UTR mogą się znajdować różne sekwencje sygnałowe:

sekwencje będące sygnałem do poliadenylacji, zazwyczaj AAUAAA^[1]
sekwencje wpływające na lokalizację mRNA w komórce^[2]
sekwencje wpływające na stabilność mRNA (na przykład sekwencje AURE bogate w adeninę i uracyl)^[3]
sekwencje wpływające na translację^[4]
miejsca wiązania miRNA^[5].

Mutacje w 3′UTR mogą powodować choroby genetyczne, między innymi mutacja punktowa sygnału do poliadenylacji w genie kodującym β-globinę może wywołać talasemię, a mutacja dynamiczna, polegająca na ekspansji sekwencji trzech nukleotydów CUG położonej w 3′UTR genu DMPK, dystrofię miotoniczną typu 1^[6].

Zobacz też

5′UTR

Przypisy

↑ T.T. Ara T.T. i inni, Conservation of alternative polyadenylation patterns in mammalian genes, „BMC Genomics”, 7, 2006, s. 189, DOI: 10.1186/1471-2164-7-189, PMID: 16872498, PMCID: PMC1550727 .
↑ J. Hesketh. 3′-Untranslated regions are important in mRNA localization and translation: lessons from selenium and metallothionein. „Biochem Soc Trans”. 32 (Pt 6), s. 990–993, 2004. DOI: 10.1042/BST0320990. PMID: 15506944.
↑ C.C. Barreau C.C., L.L. Paillard L.L., H.B.H.B. Osborne H.B.H.B., U-rich elements and associated factors: are there unifying principles?, „Nucleic Acids Research”, 22, 33, 2006, s. 7138–7150, DOI: 10.1093/nar/gki10124, PMID: 1639100, PMCID: PMC1325018 .
↑ B. Mazumder, P. Sampath, P.L. Fox. Regulation of macrophage ceruloplasmin gene expression: one paradigm of 3′-UTR-mediated translational control. „Mol Cells”. 20 (2), s. 167–172, 2005. DOI: 10.1016/j.sedgeo.2004.12.011. PMID: 16267389.
↑ M. Yang, Y. Li, R.W. Padgett. MicroRNAs: Small regulators with a big impact. „Cytokine Growth Factor Rev”. 16 (4–5), s. 387–393, 2005. DOI: 10.1016/j.cytogfr.2005.02.008. PMID: 15869899.
↑ J.M. Chen, C. Ferec, D.N. Cooper. A systematic analysis of disease-associated variants in the 3′ regulatory regions of human protein-coding genes II: the importance of mRNA secondary structure in assessing the functionality of 3′ UTR variants. „Hum Genet”. 120 (3), s. 301–333, 2006. DOI: 10.1007/s00439-006-0218-x. PMID: 16807757.

[ara-1] T.T. Ara T.T. i inni, Conservation of alternative polyadenylation patterns in mammalian genes, „BMC Genomics”, 7, 2006, s. 189, DOI: 10.1186/1471-2164-7-189, PMID: 16872498, PMCID: PMC1550727 .

[hesketh-2] J. Hesketh. 3′-Untranslated regions are important in mRNA localization and translation: lessons from selenium and metallothionein. „Biochem Soc Trans”. 32 (Pt 6), s. 990–993, 2004. DOI: 10.1042/BST0320990. PMID: 15506944.

[barreau-3] C.C. Barreau C.C., L.L. Paillard L.L., H.B.H.B. Osborne H.B.H.B., U-rich elements and associated factors: are there unifying principles?, „Nucleic Acids Research”, 22, 33, 2006, s. 7138–7150, DOI: 10.1093/nar/gki10124, PMID: 1639100, PMCID: PMC1325018 .

[mazumder-4] B. Mazumder, P. Sampath, P.L. Fox. Regulation of macrophage ceruloplasmin gene expression: one paradigm of 3′-UTR-mediated translational control. „Mol Cells”. 20 (2), s. 167–172, 2005. DOI: 10.1016/j.sedgeo.2004.12.011. PMID: 16267389.

[yang-5] M. Yang, Y. Li, R.W. Padgett. MicroRNAs: Small regulators with a big impact. „Cytokine Growth Factor Rev”. 16 (4–5), s. 387–393, 2005. DOI: 10.1016/j.cytogfr.2005.02.008. PMID: 15869899.

[chen-6] J.M. Chen, C. Ferec, D.N. Cooper. A systematic analysis of disease-associated variants in the 3′ regulatory regions of human protein-coding genes II: the importance of mRNA secondary structure in assessing the functionality of 3′ UTR variants. „Hum Genet”. 120 (3), s. 301–333, 2006. DOI: 10.1007/s00439-006-0218-x. PMID: 16807757.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]